Свято-Троицкий храм имеет большую историю. Церковь была построена сразу при постройке Новодвинской церкви. За свой продолжительный век храм был перенесен на новое место, его объединили с Богоявленской церковью, закрывался в 1930 году и возобновил свою работу в конце прошлого столетия.
В настоящее время храм является одним из самых древних храмов на территории Архангельской области.